iGEM生物训练营

2021-02-19

我们收到来自家长的疑问

iGEM到底是什么?

听说今年中国的高中生队获得了全球冠军?

这个奖项设置是怎样的?

今天我们就来仔细讲一讲iGEM这个比赛

iGEM

International Genetically Engineered Machine (国际基因工程机器大赛)

国际基因工程机器大赛是合成生物学领域的国际顶级科技赛事,也是涉及数学、计算机、统计学等领域交叉合作的跨学科竞赛。大赛起源于2003年在美国麻省理工学院的一个短期课程,2004年这门课程发展成为一个夏季赛事,2005年发展成为国际赛事。创始之初主要针对在校本科生,2011年开始纳入高中生团队参加比赛,2015年高中生开始可以和大学生团队共同参加最后的盛会——Giant Jamboree。每支iGEM团队会获得组委会提供的一组1000多个的标准生物模块(Biobricks)来构建、测试、标记基因工程系统,并在活细胞体内操作,用以解决现实生活的问题。创造出的新标准生物模块也将分享充实iGEM标准生物模块库。在赛季的末尾,参赛队伍将在云集于Giant Jamboree,以海报或者口头表述的方式展示自己的研究成果,并为奖项进行最终角逐。

2019年有来自亚、非、欧、美共353参赛队伍参加iGEM,其中亚洲队伍共167支,大部分为中国队伍。以下为亚洲队伍截图。

01

组队要求

iGEM以团队形式参赛,2020年比赛的组队要求未公布,可以参考2019年的要求:

2019年参赛的高中生团队全部的成员必须都在2019年3月31日为高中生(包括2019年春季毕业的学生)。高中生队伍只会在高中生Track与其他高中生队伍竞争。高中生团队因为参赛队员年龄偏小,参赛队伍名单由iGEM HQ控制, PI不可以自己增加,还必须提交来自校方(学校代表队伍)、机构(校外实验室)和参赛学生的同意书。根据以往参赛经验,建议每队队伍成员控制在8-15人,男女人数平衡,并且招纳来自不同专业和背景的成员组队。

队伍角色

队长 

team leader

学生联系人代表,每支队伍可提名两位学生作为队长,负责与PI和与iGEM HQ对接。需要建立iGEM账号,截止日期前加入队伍名单(team roaster)。

队员 

team members

参赛选手,负责头脑风暴、项目选择、建立和测试选择的生物系统,全程参与项目。需要建立iGEM用户账号,输入年龄信息,截止日期前加入队伍名单。

经理 

Principal investigator (PI)

队伍的官方负责人,与iGEM HQ对接的官方代表,负责整个队伍的报名申请、注册缴费、寻找赞助、收发邮件等整个赛季的相关事宜。高中生队伍的primary PI必须为教师或校长,也可以请一名教授作为其中的一个PI。需要建立iGEM账号,截止日期前加入队伍名单。

导师

Instructor

熟知团队活动和实验计划,提供实验室每日的技术训练与指导。需要建立iGEM账号,截止日期前加入队伍名单。

顾问

Advisor

辅助指导,可以是研究生、博士生、技术人员。需要建立iGEM账号,截止日期前加入队伍名单。

02

参赛时间

不同项目时间安排略有不同,通常情况下在12月-1月间组队,这个时候征得教师同意后开始招纳队员、寻求赞助并对项目进行头脑风暴。2-3月间注册报名并缴纳费用,并上传本队介绍。4月份得到iGEM HQ的反,通过队伍将获得DNA Distribution Kit。5月-9月是集中实验环节,在此之间,参赛队伍除了在实验室里研究,还要不定期参与一些活动,并及时上传成果wiki页面。夏季结束,Giant Jamboree将汇集所有参赛队伍展示他们的成果。

图片

2020年Schedule尚未公布,

阅览2019年时间安排:

  02月19日  常规报名开始日期

  04月02日  常规报名截止日期

  04月03日  晚报名开始日期

  04月19日  申请受理开始日期

  04月30日  5月晚报名开始日期

  05月01日  2019年iGEM正式开始日期

                   参赛通道(Track)选择开始日期

                   Safety Form填表开始日期

                   Visa申请开始日期

                   团队名单(Team Roster)开填日期

                   5月晚报名开始日期

  05月31日   5月晚报名截止日期

  06月28日   项目描述初稿截止日期

                    Safety Form 初稿提交截止日期

  07月03日   Giant Jamboree 报名开始日期

  09月03日   最后一名成员Giant Jamboree报名截止日期

  09月13日   参赛通道选择截止日期

                    项目名称和摘要提交截止日期

                    最终成员名单提交截止日期

                    最终Safety Form提交截止日期

  09月30日   Giant Jamboree晚报名截止日期

  10月16日   最终Judging Form提交截止日期

  10月21日   Registry 页面冻结日期

                    Wiki 页面冻结日期

  10月31日   Giant Jamboree 开启

  11月04日   Giant Jamboree 结束

03

报名费用

报名越早,费用越低。最晚报名的所有费用都必须在5月31日及以前交齐,同一学校注册两支队伍,第二支队伍报名费可减少$1,000。

参加Giant Jamboree需要额外收费:

04

奖项设置

iGEM的奖项设置有些许复杂,每个参赛队伍会从三个层面进行评选:奖牌层面、项目层面、特殊奖项。另外还有两个额外奖项。

奖牌层面

每一个参赛队伍可以且仅可以获得一个奖牌,从高到低依次为金牌(Gold Medal)、银牌(Silver Medal)和铜牌(Bronze Medal)。2019年353支参赛队伍里有163支获得金牌,77支获得银牌,57支获得铜牌。以下是部分获得金牌的参赛队伍,来自中国深圳的高中生队伍Great Bay SZ就获得了金牌。

项目层面

这对于iGEM参赛队伍来说可能是最重要的评选,决定了参赛队伍是否能够在参赛通道里获得 Track Awards,以及能否被评选为决赛队伍,参与Grand Prize(大奖)的角逐。具体的评价标准见下图:

可以看到其中有对Track(参赛通道)的具体评选要求。所有参赛队伍都必须选择唯一的一个参赛通道进行比赛。报名时可以填写另外两个备选通道,当首选通道因参赛队伍不足而被取消时可以顺延至第二或第三备选。参赛通道又可以细分为 Standard Track(标准通道)和 Special Track(特殊通道)。

Track Awards

特殊通道在Jamboree上优先获得展览空间,参赛队伍可以不研究DNA有关内容,除了大奖之外,特殊通道参赛队伍可获其他所有奖项,也可获除了本主题以外的跨通道奖。以下为2个特殊通道和对应的最佳奖项 (Track awards):

软件通道

Best Software Project

开放通道

Best Open Project

开放通道:任何不属于其他通道的研究领域比如硬件、艺术设计、测量技术等等都可以通过此通道参与比赛。

标准通道想要获得奖牌,参赛内容必须与DNA片段有关,此通道队伍有资格角逐大奖以及跨通道奖项,也可以申请在Jamboree上进行展览,但是不具有优先权。以下为根据研究领域细分的10个标准通道和对应的最佳奖项 (Track awards):

能源通道

Best Diagnostics Project

基础性革新通道Best Foundational Advance Project

治疗方法通道

Best Therapeutics Project

诊断技术通道

Best Diagnostics Project

信息处理通道 

Best Information Processing Project

食品&营养通道 Best Food & Nutrition Project

高中生通道

新型应用通道

Best New Application Project

制造业通道

Best Manufacturing Project

环境通道 

Best Environment Project

高中生通道没有官方指定的研究领域,可以选择其他通道比如能源、环境、诊断技术等研究领域,也可以其他研究领域参赛。高中生队伍比较特殊,既是高中组,又是高中通道,所以没有track award,直接进入Grand Prize的角逐。2019年共有74支高中组共同角逐Grand prize,选出唯一一支总冠军。

Grand Prize 

大奖为该竞赛的最高奖项,按照不同年龄段的三个组别进行颁奖。组委会根据整个项目造诣程度从参赛通道里选择少量几支决赛队伍角逐此奖项。本科生组选出一支大奖获得者(冠军)、一支亚军和一支季军。研究生组选出一支大奖获得者(冠军)和一支亚军。高中生组只选出一支大奖获得者(冠军)。


2019年高中生组大奖获得者为Great Bay SZ (China) ,他们生物合成了一种彩色蜘蛛丝,可充当应用于医药、纺织和航空航天领域的材料。

特殊奖项

每个参赛队伍还可以获得以下14项the Special Prizes(特殊奖项)。

Wiki

维基页面

Software Tool

软件工具

Model

模型

New Basic Part

新基本元件

Plant Synthetic Biology

植物合成生物学

Presentation

演示

Poster

海报

Measurement

测量

Hardware

硬件

Education & Public Engagement

教育&公共参与

Entrepreneurship

创业

Part Collection

组合元件

Integrated Human Practices

融合人类实践

New Composite Part

新合成元件

比如,前文提到的大奖获得者Great Bay SZ还获得了...

高中组最佳Wiki页面奖

高中组最佳演示奖

高中组最佳新基本元件奖

高中组最佳硬件奖

高中组最佳组合元件奖

额外奖项

除了以上三个层面的奖项,iGEM还有两个额外的奖项——最佳评委奖和最受欢迎奖,后者是由现场参赛队伍投票选出心中的最佳项目。以下是2019年的最受欢迎队伍奖获得者——高中组获得者还是Great Bay SZ。


看完了这些奖项介绍

你是不是也对Great Bay SZ这个队伍产生了好奇?


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